RNAseq测序reads定位
获得RNA-seq的原始数据后，首先需要将所有测序读段通过序列映射（mapping）定位到参考基因组上，这是所有后续处理和分析的基础.在读段定位之前，有时还需要根据测序数据情况对其做某些基本的预处理.
例如，过滤掉测序质量较差的读段，对miRNA测序读段数据去除接头序列等.
方法通过B-W转换将基因组序列按一定规则压缩并建立索引，再通过查找和回溯来定位读段，在查找时
不论是哪种测序平台，测序中都不可避免地存在一定的错误，基因组中又存在单核苷酸多态性等引起的序列变化，所以在读段定位时通常允许一定数量的错配，可以根据不同应用调节允许错配的程度.另一方面，由于基因组中重复序列和高相似度序列的影响，某些读段会出现定位到基因组多个位置的情况.这些因素影响了各个读段到基因组的定位质量，在一些新的读段定位算法中，同时给出每个读段与基因组匹配质量.通常在后续处理前，人们将多定位的读段都过滤掉，也有人尝试用适当的策略把多定位读段“分配”到其中某些位置上.