员工病假期间绩效工资不会被扣除，根据劳动法和相关规定，企业应按规定支付员工病假工资或疾病救济费，支付金额可以低于最低工资标准但不能低于80%。员工患病或非因工负伤需要停止工作医疗时，医疗期根据工作年限给予三个月到二十四个月的时间。
法律分析
一、员工病假期间绩效工资会被扣吗
1、根据原劳动部《关于贯彻执行〈中华人民共和国劳动法〉若干问题的意见》第五十九条规定
职工患病或非因工负伤治疗期间，在规定的医疗期内由企业按有关规定支付其病假工资或疾病救济费，病假工资或疾病救济费可以低于当地最低工资标准支付，但不能低于最低工资标准的80%。同时，根据《企业职工患病或非因工负伤医疗期规定》的相关规定，医疗期是指企业职工因患病或非因工负伤停止工作治疗休息不得解除劳动合同的时限。
2、企业职工因患病或非因工负伤，需要停止工作医疗时，根据本人实际参加工作年限和在本单位工作年限，给予三个月到二十四个月的医疗期：
拓展延伸
员工病假期间绩效工资如何计算和处理？
员工病假期间绩效工资的计算和处理方式因公司和劳动法规定而异。一般情况下，如果员工在病假期间绩效工资会被扣除，但具体扣除的比例和方式取决于公司的规定。有些公司可能会全额支付绩效工资，而另一些公司可能会按照病假期间的出勤情况进行相应的调整。此外，根据劳动法的规定，员工在病假期间享有基本工资的待遇，但是否包括绩效工资则需要参考公司的。因此，建议员工在病假期间向公司人力资源部门咨询相关，以了解具体的计算和处理方式。
结语
员工病假期间绩效工资的计算和处理方式因公司和劳动法规定而异。具体扣除比例和方式取决于公司规定，建议咨询公司人力资源部门了解。根据劳动法规定，员工在病假期间享有基本工资待遇，是否包括绩效工资需参考公司。
法律依据
中华人民共和国劳动法（2018修正）：第一章 总 则 第九条 劳动行政部门主管全国劳动工作。
县级以上地方劳动行政部门主管本行政区域内的劳动工作。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第一章 总则 第四条 【规章制度】用人单位应当依法建立和完善劳动规章制度，保障劳动者享有劳动权利、履行劳动义务。
用人单位在制定、修改或者决定有关劳动报酬、工作时间、休息休假、劳动安全卫生、保险福利、职工培训、劳动纪律以及劳动定额管理等直接涉及劳动者切身利益的规章制度或者重大事项时，应当经职工代表大会或者全体职工讨论，提出方案和意见，与工会或者职工代表平等协商确定。
在规章制度和重大事项决定实施过程中，工会或者职工认为不适当的，有权向用人单位提出，通过协商予以修改完善。
用人单位应当将直接涉及劳动者切身利益的规章制度和重大事项决定公示，或者告知劳动者。
中华人民共和国劳动合同法（2012修正）：第六章 监督检查 第七十七条 【劳动者权利救济途径】劳动者合法权益受到侵害的，有权要求有关部门依法处理，或者依法申请仲裁、提起诉讼。
